Перекис водню нестабільна і легко розкладається на кисень і воду, що з цього моменту є досить безпечним. Дослідження підтвердили, що залишки перекису водню в продуктах, змочених водою, поступово розкладаються і зникають у процесі замочування, а подальша обробка також швидко їх знищує.
У 2004 році Комітет експертів Всесвітньої організації охорони здоров’я (JECFA) оцінив, що залишки перекису водню в харчових продуктах настільки низькі, що до того часу, коли споживачі їх їдять, він розпадається майже до такого рівня, що не викликає занепокоєння, тому немає потреби встановити «безпечне споживання».
Управління з контролю за якістю харчових продуктів і медикаментів США також класифікує перекис водню як GRAS (тобто достатньо безпечний) і зазвичай використовується в кількості, необхідній для виробництва (тобто необмежене використання). Наприклад, максимальна кількість, яка використовується в копченій блакитній рибі та маринованих яйцях, — це «для досягнення окислювального та антибактеріального ефекту», а максимальна кількість, яка використовується при переробці рубця, — «для досягнення ефекту відбілювання». Крім того, перекис водню також можна використовувати для очищення та дезінфекції фруктів і овочів.
Медична перекис водню з концентрацією 3 відсотки, як правило, не є великою проблемою, навіть якщо її прийняти помилково. Але якщо перекис водню з концентрацією 30 відсотків випити безпосередньо, це може призвести до опіку травного тракту. Однак це вкрай рідко, оскільки звичайна людина не контактує з такою високою концентрацією перекису водню.
Крім того, перекис водню може швидко розкладатися в солях важких металів, лужному середовищі та сильних ударах і навіть викликати вибухи. Це, як правило, відбувається під час виробництва, зберігання та транспортування перекису водню, і навряд чи з цим стикаються споживачі.